MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium chubuense NBB4 plasmid pMYCCH.02

Total Repeats: 3296

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_018023	CCT	2	6	50492	50497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392406309
1002	NC_018023	CGC	2	6	50528	50533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406309
1003	NC_018023	CTTC	2	8	50555	50562	0 %	50 %	0 %	50 %	392406309
1004	NC_018023	AGA	2	6	50597	50602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392406309
1005	NC_018023	AC	3	6	50609	50614	50 %	0 %	0 %	50 %	392406309
1006	NC_018023	GTC	2	6	50625	50630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406309
1007	NC_018023	TCG	2	6	50668	50673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406309
1008	NC_018023	CT	3	6	50713	50718	0 %	50 %	0 %	50 %	392406309
1009	NC_018023	GAGC	2	8	50927	50934	25 %	0 %	50 %	25 %	392406309
1010	NC_018023	CCT	2	6	50939	50944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392406309
1011	NC_018023	AGTTG	2	10	50988	50997	20 %	40 %	40 %	0 %	392406309
1012	NC_018023	CGC	2	6	51048	51053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406309
1013	NC_018023	CA	3	6	51075	51080	50 %	0 %	0 %	50 %	392406309
1014	NC_018023	TCG	2	6	51128	51133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406309
1015	NC_018023	CGC	2	6	51138	51143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406309
1016	NC_018023	GAT	2	6	51168	51173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392406309
1017	NC_018023	GCC	2	6	51189	51194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406309
1018	NC_018023	CGT	2	6	51221	51226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406309
1019	NC_018023	GCG	2	6	51282	51287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406309
1020	NC_018023	GAG	2	6	51288	51293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392406309
1021	NC_018023	CGG	2	6	51305	51310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406309
1022	NC_018023	GCG	2	6	51314	51319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406309
1023	NC_018023	CTT	2	6	51342	51347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392406309
1024	NC_018023	GTTCG	2	10	51381	51390	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1025	NC_018023	GC	3	6	51440	51445	0 %	0 %	50 %	50 %	392406310
1026	NC_018023	GCC	2	6	51474	51479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406310
1027	NC_018023	CGGGC	2	10	51660	51669	0 %	0 %	60 %	40 %	392406310
1028	NC_018023	TCA	2	6	51785	51790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392406310
1029	NC_018023	CGC	2	6	51818	51823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406310
1030	NC_018023	GCT	2	6	51837	51842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406310
1031	NC_018023	TCGACC	2	12	52013	52024	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	392406310
1032	NC_018023	GGA	2	6	52051	52056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392406310
1033	NC_018023	CCGG	2	8	52074	52081	0 %	0 %	50 %	50 %	392406310
1034	NC_018023	CTT	3	9	52137	52145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392406310
1035	NC_018023	CG	3	6	52247	52252	0 %	0 %	50 %	50 %	392406310
1036	NC_018023	GTCG	2	8	52255	52262	0 %	25 %	50 %	25 %	392406310
1037	NC_018023	AGC	2	6	52263	52268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406310
1038	NC_018023	GCT	2	6	52374	52379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_018023	CGT	2	6	52429	52434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_018023	AGCG	2	8	52521	52528	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1041	NC_018023	GTC	2	6	52566	52571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406311
1042	NC_018023	AGGT	2	8	52579	52586	25 %	25 %	50 %	0 %	392406311
1043	NC_018023	TCC	2	6	52601	52606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392406311
1044	NC_018023	TGTCG	2	10	52621	52630	0 %	40 %	40 %	20 %	392406311
1045	NC_018023	TGGT	2	8	52687	52694	0 %	50 %	50 %	0 %	392406311
1046	NC_018023	CTGG	2	8	52786	52793	0 %	25 %	50 %	25 %	392406311
1047	NC_018023	TCG	2	6	52811	52816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406311
1048	NC_018023	AGC	2	6	52859	52864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406311
1049	NC_018023	GGCC	2	8	52916	52923	0 %	0 %	50 %	50 %	392406311
1050	NC_018023	GAG	2	6	52954	52959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392406311
1051	NC_018023	GTC	2	6	52987	52992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406311
1052	NC_018023	TTCG	2	8	53158	53165	0 %	50 %	25 %	25 %	392406311
1053	NC_018023	CGT	2	6	53190	53195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406311
1054	NC_018023	CGG	2	6	53228	53233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406311
1055	NC_018023	TCG	2	6	53393	53398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406311
1056	NC_018023	CAG	2	6	53464	53469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406311
1057	NC_018023	CAGGA	2	10	53558	53567	40 %	0 %	40 %	20 %	392406311
1058	NC_018023	CGC	2	6	53640	53645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406312
1059	NC_018023	CCG	2	6	53675	53680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406312
1060	NC_018023	CGG	2	6	53723	53728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406312
1061	NC_018023	AGT	2	6	53849	53854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392406312
1062	NC_018023	GAT	2	6	53910	53915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392406312
1063	NC_018023	CTT	2	6	53988	53993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392406312
1064	NC_018023	AGC	2	6	53995	54000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406312
1065	NC_018023	TCG	2	6	54025	54030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406312
1066	NC_018023	TG	3	6	54036	54041	0 %	50 %	50 %	0 %	392406312
1067	NC_018023	TCA	2	6	54122	54127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392406312
1068	NC_018023	CAT	2	6	54152	54157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_018023	GCC	2	6	54271	54276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1070	NC_018023	CGA	2	6	54300	54305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_018023	ATC	2	6	54379	54384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392406313
1072	NC_018023	GC	3	6	54387	54392	0 %	0 %	50 %	50 %	392406313
1073	NC_018023	GC	3	6	54398	54403	0 %	0 %	50 %	50 %	392406313
1074	NC_018023	CAC	2	6	54424	54429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392406313
1075	NC_018023	GCG	2	6	54510	54515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406313
1076	NC_018023	GCTT	2	8	54560	54567	0 %	50 %	25 %	25 %	392406313
1077	NC_018023	CGAC	2	8	54674	54681	25 %	0 %	25 %	50 %	392406313
1078	NC_018023	GTC	2	6	54688	54693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406313
1079	NC_018023	CGT	2	6	54700	54705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406313
1080	NC_018023	CGA	2	6	54709	54714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406313
1081	NC_018023	TCCG	2	8	54728	54735	0 %	25 %	25 %	50 %	392406313
1082	NC_018023	CTG	2	6	54791	54796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406313
1083	NC_018023	GTAG	2	8	54850	54857	25 %	25 %	50 %	0 %	392406313
1084	NC_018023	CTC	2	6	54899	54904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392406313
1085	NC_018023	GC	3	6	54905	54910	0 %	0 %	50 %	50 %	392406313
1086	NC_018023	TCT	2	6	54913	54918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392406313
1087	NC_018023	GTC	2	6	55025	55030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406314
1088	NC_018023	TCG	2	6	55032	55037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406314
1089	NC_018023	GCA	2	6	55054	55059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406314
1090	NC_018023	TCCG	2	8	55089	55096	0 %	25 %	25 %	50 %	392406314
1091	NC_018023	GTC	2	6	55107	55112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406314
1092	NC_018023	CAA	2	6	55159	55164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392406314
1093	NC_018023	GAG	2	6	55205	55210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392406314
1094	NC_018023	GGAC	2	8	55211	55218	25 %	0 %	50 %	25 %	392406314
1095	NC_018023	GCGG	2	8	55268	55275	0 %	0 %	75 %	25 %	392406314
1096	NC_018023	CTCG	2	8	55331	55338	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1097	NC_018023	TC	3	6	55391	55396	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1098	NC_018023	GT	3	6	55397	55402	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_018023	CGT	2	6	55475	55480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406315
1100	NC_018023	CGC	2	6	55526	55531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406315
1101	NC_018023	GCC	2	6	55635	55640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406315
1102	NC_018023	CGA	2	6	55697	55702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406315
1103	NC_018023	TCG	2	6	55729	55734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406315
1104	NC_018023	CGG	3	9	55775	55783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406315
1105	NC_018023	CGA	2	6	55911	55916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406316
1106	NC_018023	CCG	2	6	55979	55984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406316
1107	NC_018023	CGG	2	6	56128	56133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406316
1108	NC_018023	GCG	2	6	56181	56186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406316
1109	NC_018023	CCG	2	6	56277	56282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406317
1110	NC_018023	CG	4	8	56304	56311	0 %	0 %	50 %	50 %	392406317
1111	NC_018023	ACC	2	6	56347	56352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392406317
1112	NC_018023	CGCT	2	8	56353	56360	0 %	25 %	25 %	50 %	392406317
1113	NC_018023	GC	3	6	56361	56366	0 %	0 %	50 %	50 %	392406317
1114	NC_018023	CTGG	2	8	56406	56413	0 %	25 %	50 %	25 %	392406317
1115	NC_018023	CGT	2	6	56448	56453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406317
1116	NC_018023	CCCG	2	8	56461	56468	0 %	0 %	25 %	75 %	392406317
1117	NC_018023	CTC	2	6	56488	56493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392406317
1118	NC_018023	GGC	2	6	56514	56519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406317
1119	NC_018023	CGCA	2	8	56526	56533	25 %	0 %	25 %	50 %	392406317
1120	NC_018023	GAC	2	6	56602	56607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406317
1121	NC_018023	GAG	2	6	56687	56692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392406317
1122	NC_018023	CCA	2	6	56700	56705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392406317
1123	NC_018023	CGA	3	9	56736	56744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406317
1124	NC_018023	CGT	2	6	56754	56759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406317
1125	NC_018023	GC	3	6	56795	56800	0 %	0 %	50 %	50 %	392406317
1126	NC_018023	GAC	2	6	56817	56822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406318
1127	NC_018023	CG	5	10	56838	56847	0 %	0 %	50 %	50 %	392406318
1128	NC_018023	CGG	2	6	56867	56872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406318
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1230	NC_018023	AAG	2	6	61489	61494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1231	NC_018023	CGG	2	6	61551	61556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1233	NC_018023	GATG	2	8	61643	61650	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1234	NC_018023	GC	3	6	61682	61687	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1235	NC_018023	TGC	2	6	61703	61708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1237	NC_018023	GCCC	2	8	61899	61906	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1238	NC_018023	AGA	2	6	61978	61983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1239	NC_018023	CAG	2	6	62039	62044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1240	NC_018023	CGCCTG	2	12	62223	62234	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	392406322
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1247	NC_018023	CACCG	2	10	62559	62568	20 %	0 %	20 %	60 %	392406322
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1251	NC_018023	CG	3	6	62736	62741	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1252	NC_018023	GAG	2	6	62775	62780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1253	NC_018023	GCC	2	6	62784	62789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1254	NC_018023	AC	3	6	62912	62917	50 %	0 %	0 %	50 %	392406323
1255	NC_018023	ACA	2	6	62968	62973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392406323
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1262	NC_018023	GCC	2	6	63204	63209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406324
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1277	NC_018023	CGC	2	6	63572	63577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1331	NC_018023	CCG	2	6	65841	65846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1368	NC_018023	CGC	2	6	67053	67058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1369	NC_018023	CAC	2	6	67063	67068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1371	NC_018023	CCGCC	2	10	67185	67194	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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1373	NC_018023	CA	3	6	67211	67216	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1380	NC_018023	GTCT	2	8	67382	67389	0 %	50 %	25 %	25 %	392406328
1381	NC_018023	GTC	2	6	67401	67406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406328
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